I KILLING FLOOR 2 sänks spelare ner till kontinentala Europa där utbrottet som orsakats av Horzine Biotechs misslyckade experiment snabbt sprider sig och uppnådde en oupplöslig momentum, som i huvudsak förlamar Europeiska unionen. En månad efter händelserna i den ursprungliga KILLING FLOOREN är provklonerna överallt och civilisationen är i oreda, Kommunikationen har misslyckats, regeringarna har kollapsat och militära styrkor har systematiskt utrotats. Europas folk känner överlevnad och självförvaring för bra och lyckliga överlevande har gått och gömmt sig.
Inte alla har gett upp hoppet … En grupp civila och legosoldater har bundits ihop för att bekämpa utbrottet och etablerade privatfinansierade verksamhetsbaser över hela Europa. Vid spårning av klonutbrott kommer spelarna att sjunka ner i zed fyllda områden och utrota dem.